El 14 de diciembre de 2005, en sesión ordinaria del Consejo Consultivo, Órgano Supremo de la Comisión de Derechos Humanos del Estado, se acordó por unanimidad la creación del Instituto de Estudios en Derechos Humanos (INEDH), cuyo objetivo es desarrollar y ejecutar las acciones relativas al diseño, planeación, organización y evaluación de programas de capacitación, promoción, divulgación, formación, e investigación, así como estudios de posgrado que en materia de Derechos Humanos se impartan al personal de la Comisión de Derechos Humanos del Estado de Campeche, a personal de instituciones públicas, privadas y a población abierta, para ello se realizaron las gestiones correspondientes ante la Secretaría de Educación Pública y el 24 de noviembre del año 2006, se expidió para la operatividad de este Órgano Académico la clave del Centro de Trabajo: 04OSU0002H y clave de Institución Educativa: 04MSU0031E.
Posteriormente, con la finalidad de incrementar el nivel académico de los servidores públicos y profesionistas al interior del Estado, se realizaron los trámites relativos para la apertura de una sede en el municipio de Carmen, Campeche, lo cual fue concretado el día 22 de abril del año 2009, fecha en la que se expidió la Clave del Centro de Trabajo: 04OSU0003G, autorizando de esta manera la impartición de estudios de posgrado en tal municipio.